总分公司税率不同如何汇总纳税
根据《国家税务总局关于印发〈跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法〉的公告》（国家税务总局公告2012年第57号）第十八条规定，对于按照税收法律、法规和其他规定，总机构和分支机构处于不同税率地区的，先由总机构统一计算全部应纳税所得额，然后按本办法第六条规定的比例和按第十五条计算的分摊比例，计算划分不同税率地区机构的应纳税所得额，再分别按各自的适用税率计算应纳税额后加总计算出汇总纳税企业的应纳所得税总额，最后按本办法第六条规定的比例和按第十五条计算的分摊比例，向总机构和分支机构分摊就地缴纳的企业所得税款。
根据国家税务总局2012年第57号公告 第六条规定，汇总纳税企业按照《企业所得税法》规定汇总计算的企业所得税，包括预缴税款和汇算清缴应缴应退税款，50%在各分支机构间分摊，各分支机构根据分摊税款就地办理缴库或退库；50%由总机构分摊缴纳，其中25%就地办理缴库或退库，25%就地全额缴入中央国库或退库。
根据国家税务总局2012年第57号公告 第十五条规定，总机构应按照上年度分支机构的营业收入、职工薪酬和资产总额三个因素计算各分支机构分摊所得税款的比例；三级及以下分支机构，其营业收入、职工薪酬和资产总额统一计入二级分支机构；三因素的权重依次为0.35、0.35、0.30。
计算公式如下：
某分支机构分摊比例=(该分支机构营业收入/各分支机构营业收入之和)×0.35+(该分支机构职工薪酬/各分支机构职工薪酬之和)×0.35+(该分支机构资产总额/各分支机构资产总额之和)×0.30
分支机构分摊比例按上述方法一经确定后，除出现本办法第五条第(四)项和第十六条第二、三款情形外，当年不作调整。
根据国家税务总局2012年第57号公告 第十六条规定，总机构设立具有主体生产经营职能的部门(非本办法第四条规定的二级分支机构)，且该部门的营业收入、职工薪酬和资产总额与管理职能部门分开核算的，可将该部门视同一个二级分支机构，按本办法规定计算分摊并就地缴纳企业所得税；该部门与管理职能部门的营业收入、职工薪酬和资产总额不能分开核算的，该部门不得视同一个二级分支机构，不得按本办法规定计算分摊并就地缴纳企业所得税。
举个例子
跨地区经营汇总纳税企业甲公司2019年度应纳税所得额为400万元，总公司位于上海市，另外在重庆有一个分公司A，在上海有一个具有主体生产经营职能的部门B, A分公司和B部门2019年度的三个因素情况如下表所示，其中A分公司适用西部大开发15%税率优惠政策，同时总机构和B部门适用税率均为25%。如何计算总公司和分公司分摊就地缴纳的企业所得税款呢？
第一步：总公司统一计算全部应纳税所得额400万元
第二步：计算各分公司分摊比例
A分公司分摊比例=(A分公司营业收入/各分公司营业收入之和)×0.35+(A分公司职工薪酬/各分公司职工薪酬之和)×0.35+(A分公司资产总额/各分公司资产总额之和)×0.30=（500/1000）×0.35+(80/160)×0.35+(1500/3000)×0.30=0.5
B部门分摊比例=(B部门营业收入/各分公司营业收入之和)×0.35+(B部门职工薪酬/各分公司职工薪酬之和)×0.35+(B部门资产总额/各分公司资产总额之和)×0.30=（500/1000）×0.35+(80/160)×0.35+(1500/3000)×0.30=0.5
第三步：计算划分各公司应纳税所得额
总公司分摊所得额＝400×50%=200万元
A分公司分摊应纳税所得额＝400×50%×0.5=100万元
B部门分摊应纳税所得额＝400×50%×0.5=100万元
第四步：计算不同税率地区的应纳所得税总额
总公司应纳所得税额＝200×25%=50万元
A分公司应纳所得税额＝100×15%=15万元
B部门应纳所得税额＝100×25%=25万元
甲公司2019年度应纳所得税总额=50＋15＋25=90万元
第五步：向总公司和分公司分摊就地缴纳的企业所得税款
总公司分摊就地缴纳的企业所得税款＝90×50%=45万元
A分公司分摊就地缴纳的企业所得税款＝90×50%×50%=22.5万元
B部门分摊就地缴纳的企业所得税款＝90×50%×50%=22.5万元
特别提醒：总公司在申报企业所得税年度纳税申报表时，总机构《减免所得税优惠明细表》（A107040）第21行填报享受的优惠金额10（400×25%-90）万元。
热点问答
01、哪些二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税？
（1）不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
（2）上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
（3）新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。
（4）当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。
（5）汇总纳税企业在中国境外设立的不具有法人资格的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
02、汇总纳税企业分支机构在备案时需要注意些什么？
汇总纳税企业分支机构应依法办理税务登记，接受所在地主管税务机关的监督和管理。
分支机构应将其总机构、上级分支机构和下属分支机构信息报其所在地主管税务机关备案，内容包括总机构、上级机构和下属分支机构名称、层级、地址、邮编、纳税人识别号及企业所得税主管税务机关名称、地址和邮编。
上述备案信息发生变化的，除另有规定外，应在内容变化后30日内报所在地主管税务机关备案，并办理变更税务登记。
特别提醒 ：变更总分支机构信息，企业所得税汇总纳税信息报告均可以在电子税务局办理。
03、汇总纳税企业分支机构在汇算清缴时需要注意些什么？
汇总纳税企业汇算清缴时，分支机构除报送企业所得税年度纳税申报表（只填列部分项目）外，还应报送经总机构所在地主管税务机关受理的汇总纳税企业分支机构所得税分配表、分支机构的年度财务报表（或年度财务状况和营业收支情况）和分支机构参与企业年度纳税调整情况的说明。分支机构参与企业年度纳税调整情况的说明，可参照企业所得税年度纳税申报表附表“纳税调整项目明细表”中列明的项目进行说明，涉及需由总机构统一计算调整的项目不进行说明。
04、跨地区经营汇总纳税企业的分支机构的分摊比例当年可以进行调整吗？
答：根据国家税务总局2012年第57号公告第十五条规定，分支机构分摊比例按《办法》规定方法一经确定后，当年一般不作调整，即在当年预缴税款和汇算清缴时均采用同一分摊比例。但如出现《办法》第五条第（四）项（当年撤销分支机构不再参与分摊）和第十六条第二款（总机构设立具有主体生产经营职能部门视同分支机构，参与分摊）、第三款（企业外部重组与内部重组形成新分支机构不视同新设分支机构，参与分摊）情形的，应重新计算分摊比例